Isolasi dan Karakterisasi Genom Lymphocystivirus platichthys1 pada Ikan Kakap Laut Spotted Seabass Lateolabrax maculatus yang Dibudidayakan di Air Payau di Zhuhai, Cina Selatan

ABSTRAK
Virus penyakit limfosistis (LCDV) merupakan salah satu agen penyebab yang paling luas penyebarannya dan memengaruhi beragam teleost di seluruh dunia. Menurut literatur, LCDV mencakup empat spesies, dan Lymphocystivirus paralichthys1 (dikenal sebagai LCDV-C) telah lama dianggap sebagai isolat epidemi nasional yang dominan di daratan Tiongkok. Dalam penelitian ini, dua contoh kematian massal yang parah yang terkait dengan LCDV pada ikan bass tutul muda yang dibudidayakan di air payau di Zhuhai, Tiongkok Selatan, dipantau mulai awal April 2023. Jumlah kematian dalam kedua kasus ini mencapai puncaknya masing-masing sekitar 4.000 dan 10.000 ikan per hari, dengan kematian kumulatif mencapai sekitar 70% dalam waktu 19 hari sejak wabah penyakit. Berdasarkan gejala klinis, analisis histopatologi, dan pengamatan mikroskop elektron transmisi, penyakit tersebut didiagnosis sebagai infeksi LCDV. Virus diisolasi menggunakan garis sel benih ikan Mandarin (MFF-1) dan diberi nama LCDV-ZH04/23. Selanjutnya, LCDV-ZH04/23 dimurnikan secara kasar, dan seluruh genomnya diurutkan dan diberi anotasi. Hasilnya menunjukkan bahwa ZH04/23 terdiri dari 102.661 pasangan basa, mengkodekan 108 gen virus putatif dan memiliki kandungan G/C sebesar 29,3%. Analisis kolinearitas genomik mengungkapkan bahwa seluruh genom ZH04/23 menunjukkan kesamaan tertinggi (99,9%) dengan Lymphocystivirus platichthys1 (LCDV-1) yang terkenal dari Eropa, tetapi menunjukkan divergensi yang signifikan dari tiga spesies LCDV lainnya. Secara kolektif, penelitian ini menandai isolasi dan karakterisasi pertama L. platichthys1 pada tingkat seluruh genom dari kasus kematian massal yang parah pada ikan kerapu tutul yang dibudidayakan di kolam di Cina. Selain itu, penelitian ini merupakan yang pertama kali mengidentifikasi L. platichthys1 sebagai patogen baru pada ikan bass laut tutul yang dibudidayakan.